Nom : Ory
Prénom :Jérôme
Adresse mail : jerome.ory@hotmail.fr
Titre de la thèse : Effluents hospitaliers : sources d’antibiotiques ? Facilitateurs de résistances dans les Biofilms ?
Année de soutenance prévue : novembre 2017
Équipe d’accueil : Laboratoire Microorganisme Génome et Environnement, équipe Communautés Microorganismes : Écotoxicologie-Santé
Encadrant: Ousmane Traore
Résumé de la thèse
De nombreux antibiotiques sont administrés aux patients dans les hôpitaux, et sont retrouvés dans les effluents hospitaliers, eux-mêmes mélangés aux effluents urbains sans aucun traitement préalable. Certains antibiotiques peuvent impacter la flore microbienne environnementale, y compris à des doses très faibles, et favoriser favorisant la sélection de mutants résistants.
Ce projet consiste à démontrer si le biofilm des effluents hospitaliers est vecteur d’antibiorésistance d’origine hospitalière. L’étude portera sur un biofilm naturellement constitué dans les effluents hospitaliers, et nous y étudierons la composition microbienne. La caractérisation phénotypique des isolats sera effectuée, suivie d’une analyse génotypique, afin d’identifier leurs gènes de résistance. Nous collecterons les informations hospitalières relatives à la consommation des antibiotiques ainsi qu’à l’isolement de bactéries résistantes chez les patients hospitalisés pendant cette même période. A partir de ces résultats, nous serons en mesure d’effectuer une comparaison des souches résistantes issues des eaux usées et de l’hôpital et d’évaluer le risque écotoxicologique des effluents hospitaliers.
Ces données permettront d’appréhender l’impact des effluents hospitaliers dans les systèmes d’évacuation urbains, en termes de pollution médicamenteuse, mais également sous la forme d’enrichissement en bactéries véhiculant des gènes de résistance aux antibiotiques.
Mots-clés
– Biofilm
– Effluent hospitalier
– Antibiotiques
– Antibiorésistances
– Carbapénèmases
Publication associée à la thèse
– Ciprofloxacin residue and antibiotic-resistant biofilm bacteria in hospital effluent. Ory J, Bricheux G, Togola A, Bonnet JL, Donnadieu-Bernard F, Nakusi L, Forestier C, Traore O. Environmental Pollution 2016, 214, 635-645.