Nom : Keck
Prénom : François
Adresse mail : francois.keck@thonon.inra.fr
Titre de la thèse : Évaluation des liens entre phylogénie et traits écologiques, piste d’utilisation pour la bioindication des cours d’eau.
Année de soutenance prévue : 2016
Équipe d’accueil : INRA – UMR CARRTEL – Equipe RITOXE
Encadrants :
– Dr Alain FRANC, HDR, Directeur de Recherche INRA, UMR BioGeCo, Cestas, France
– Dr Agnès BOUCHEZ, Chargée de Recherche INRA, UMR CARRTEL, Thonon-Les-Bains, France
– Dr Frédéric RIMET, Ingénieur d’étude INRA, UMR CARRTEL, Thonon-Les-Bains, France
Résumé de la thèse
L’évaluation de la qualité environnementale est une question cruciale pour les écosystèmes aquatiques, et peut se faire a priori (modèles de prédiction) ou a posteriori (biomarqueurs ou bioindication). Les diatomées sont utilisées en routine pour répondre à ces questions en raison du fait que certains groupes sont sensibles et d’autres tolérants à la qualité du milieu et aux polluants. Cependant, la question de savoir ce qu’est un groupe approprié au biomonitoring reste ouverte. Le groupe pertinent se situe-t-il au niveau de l’espèce, du genre, un niveau taxonomique plus élevé ou faut-il envisager d’utiliser un mélange de niveaux taxonomiques ? Utiliser les liens phylogénétiques entre les espèces, reflets de leur histoire évolutive, permettrait-il d’améliorer l’évaluation de leur polluo-sensibilité ? Les objectifs principaux de cette thèse seront 1/ d’évaluer les liens potentiels entre phylogénie et traits écologiques chez les diatomées. 2/ D’évaluer la variabilité de ce lien au niveau intraspécifique afin de mieux comprendre la fiabilité du lien mis en évidence précédemment. 3/ Mettre en œuvre des méthodes statistiques appropriées pour détecter ce signal, identifier les niveaux taxonomiques impliqués dans ce signal et travailler sur plusieurs traits en approche multivariée.
Mots-clés
– Phylogénie
– Traits écologiques
– Phytobenthos
– Bioindication
Publications associées à la thèse