Nom : Noël
Prénom : Cyril
Adresse mail : cyril.noel@univ-pau.fr
Titre de la thèse : Réseaux microbiens de dégradation des hydrocarbures aux interfaces oxie/anoxie dans les écosystèmes marins côtiers
Année de soutenance prévue : 2017
Équipe d’accueil : Équipe Environnement et Microbiologie (IPREM-EEM UMR CNRS 5254)
Encadrant(s) : Cristiana Cravo-Laureau, Christine Cagnon et Robert Duran
Résumé de la thèse
Les sédiments marins côtiers constituent des écosystèmes fonctionnels uniques constamment soumis à des alternances d’oxygénation (cycles de marées, activités de bioturbation de la macrofaune). En raison de leur localisation, ils sont particulièrement exposés à des pollutions telles que les déversements de pétrole. Les communautés microbiennes jouent un rôle essentiel dans les cycles biogéochimiques des sédiments marins. Ce projet de thèse a donc pour objectif de comprendre comment les oscillations oxie/anoxie affectent la diversité et la structure de ces cohortes microbiennes clés pour la dégradation des hydrocarbures et le fonctionnement global des écosystèmes. Ceci est entrepris en appliquant une approche intégrée interdisciplinaire, utilisant les nouvelles techniques de séquençage combinées avec des méthodes à haut-débit permettant d’aborder les fonctions mettant en œuvre des approches de biologie computationnelle.
Mots-clés
– Hydrocarbures
– Séquençage haut-débit
– Oscillations oxie/anoxie
– Sédiments marins
– Communautés microbiennes
Publications associées à la thèse